<div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote">---------- Forwarded message ----------<br>From: <b class="gmail_sendername">Danica Fabrigar</b> <span dir="ltr"><<a href="mailto:danica_714@hotmail.com">danica_714@hotmail.com</a>></span><br>
Date: Wed, Nov 6, 2013 at 6:19 PM<br>Subject: RE: [adegenet-forum] read.plink: Multiple cores is not supported on Windows<br>To: Caitlin Collins <<a href="mailto:caitiecollins17@gmail.com">caitiecollins17@gmail.com</a>><br>
<br><br>


<div><div dir="ltr">Hi Caitlin,<div><br></div><div>That did the trick. </div><div><br></div><div>Thanks you,</div><div>Danica<br><div class="hm HOEnZb"><br></div><div><div class="hm HOEnZb"><hr>Date: Wed, 6 Nov 2013 17:57:23 +0000<br>
Subject: Re: [adegenet-forum] read.plink: Multiple cores is not supported on Windows<br>From: <a href="mailto:caitiecollins17@gmail.com" target="_blank">caitiecollins17@gmail.com</a><br>To: <a href="mailto:danica_714@hotmail.com" target="_blank">danica_714@hotmail.com</a></div>
<div><div class="h5"><br><br><div dir="ltr">Hi Danica, <br><br>While I cannot be certain without knowing precisely what you did to initiate the upload, I will say that this error message is usually resolved by adding the argument <b>parallel=FALSE</b> to the argument list of the function you called.<br>

(Note: in older versions of adegenet this used to be multicore=FALSE). <br><br>Hope that helps. <br><br>Best, <br>Caitlin. </div><div><br><br><div>On Wed, Nov 6, 2013 at 4:22 PM, Danica Fabrigar <span dir="ltr"><<a href="mailto:danica_714@hotmail.com" target="_blank">danica_714@hotmail.com</a>></span> wrote:<br>

<blockquote style="border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">


<div><div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am trying to upload my SNP dataset in the PLINK format, however I get the following error message:</div><div><br></div><div><div><font color="#ac193d">Reading PLINK raw format into a genlight object... </font></div>

<div><font color="#ac193d"><br></font></div><div><font color="#ac193d">Loading required package: parallel</font></div><div><font color="#ac193d"><br></font></div><div><font color="#ac193d"> Reading loci information... </font></div>

<div><font color="#ac193d"><br></font></div><div><font color="#ac193d"> Reading and converting genotypes... </font></div><div><font color="#ac193d">.Error in mclapply(txt, function(e) new("SNPbin", snp = e, ploidy = 2),  : </font></div>

<div><font color="#ac193d">  'mc.cores' > 1 is not supported on Windows</font></div></div><div><font color="#ac193d"><br></font></div><div><font color="#ac193d"><br></font></div><div><br></div><div>Is there a solution to this problem?</div>

<div><br></div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>Danica</div>                                     </div></div>
<br>_______________________________________________<br>
adegenet-forum mailing list<br>
<a href="mailto:adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org" target="_blank">adegenet-forum@lists.r-forge.r-project.org</a><br>
<a href="https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum" target="_blank">https://lists.r-forge.r-project.org/cgi-bin/mailman/listinfo/adegenet-forum</a><br></blockquote></div><br></div></div>
</div></div></div>                                      </div></div>
</div><br></div>