<div dir="ltr">Hey<div>(Windows Vista, R 3.0.0)</div><div>I've read in a genepop file with microsatellite data (diploid, 9 loci, 120 samples, 8 populations) and coverted it to genind.</div><div><br></div><div>I was trying to use the xvalDapc function but I received the following error message:</div>
<div><div><br></div></div><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px"><div><div>Error in dudi.pca(x, nf = n.pca.max, scannf = FALSE, center = center,  : </div></div></blockquote><blockquote style="margin:0px 0px 0px 40px;border:none;padding:0px">
<div><div>  na entries in table</div></div><div><br></div></blockquote>I've checked, there are "NA"s and they correspond to my samples with missing data.<div>I couldn't find anything on the web on how to deal with missing data for this function but I saw  Thibaut suggested replacing NA's with uninformative mean values. </div>
<div>here: <a href="http://r.789695.n4.nabble.com/PCA-with-NA-td840762.html">http://r.789695.n4.nabble.com/PCA-with-NA-td840762.html</a></div><div><br></div><div> Would this solution be permissible for this function and this type of data?</div>
<div><br></div><div>Thank you in advance</div><div>Ryan</div></div>