Hi Thibaut and Adegenet users,<div><br></div><div>I have what I think is a simple/quick question, but have not been able to figure out on my own or via the archives. I have a dataset (Genepop formatted) I have been working with to conduct DAPC and create a scatterplot. I have a legend with each population/sampling site name listed (there are 13), which roughly corresponds to the population/site names within the Genepop file (between each "POP" line). I would like to include these same labels within each of the 13 centroids on the scatterplot, but currently when I set "clab=1" the labels are displayed "P01", "P02"... "P13" rather than the names of the populations/sites in the data file or the object created to put this names in the legend. </div>
<div><br></div><div>Do you know how I can change these labels, either manually with a new object for the "clab=" command to use, or for "scatter" to refer to in the Genepop input file? I see in the H3N2 example, that the labels were amended to the epidemic years - I think using the "pop(H3N2) <- H3N2$other$epid" line. But I can't figure out how to display the H3N2 data to see how the "epid" item is incorporated into the file. </div>
<div><br></div><div>Thank you in advance for any advice or insights.</div><div><br></div><div>Jonathan</div><div><br></div>