Hello,<br><br>I noticed a little error pop up when attempting to convert the rupica dataset to a data frame with each allele in a separate column:<br><br><blockquote style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex;font-family:courier new,monospace" class="gmail_quote">
> genind2df(rupica, oneColPerAll=T)<br>Error in data.frame(Bm1818 = c("272", "272", "272", "272", "272", "280",  : <br>  arguments imply differing number of rows: 335, 334<br>
In addition: Warning messages:<br>1: In matrix(unlist(e), ncol = x@ploidy, byrow = TRUE) :<br>  data length [669] is not a sub-multiple or multiple of the number of rows [335]<br>2: In matrix(unlist(e), ncol = x@ploidy, byrow = TRUE) :<br>
  data length [667] is not a sub-multiple or multiple of the number of rows [334]<br></blockquote><div><br>It appears that some genotypes do not list both alleles and do not indicate missing data. From other data sets in adegenet, I gathered that missing data was coded as "NA". <br>
<br>Were these supposed to be indicated as homozygous or are they actually missing, and if they are missing, why are they not coded in the normal fashion? <br><br>Cheers,<br>Zhian Kamvar<br></div>