
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    I have a heap of genotypes&nbsp; in text files arranged with two columns

    per locus ( they are diploid)<br>

    <br>

    How can I quickly import and format these as one column per locus&nbsp;

    given the number of loci varies&nbsp; <br>

    <br>

    alternatively is it possible to import the tow column per locus

    table as geno into genind directly?<br>

    <br>

    <br>

    ie <br>

    <br>

    my data is formatted<br>

    &nbsp; BMC3_1 BMC3_2 Cpi4_1 Cpi4_2 epic23989s_1 epic23989s_2<br>

    1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286&nbsp;&nbsp;&nbsp; 288&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284<br>

    2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 116&nbsp;&nbsp;&nbsp; 116&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284&nbsp;&nbsp;&nbsp; 308&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286<br>

    3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 108&nbsp;&nbsp;&nbsp; 116&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302&nbsp;&nbsp;&nbsp; 304&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 288<br>

    4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106&nbsp;&nbsp;&nbsp; 118&nbsp;&nbsp;&nbsp; 288&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286<br>

    5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98&nbsp;&nbsp;&nbsp; 294&nbsp;&nbsp;&nbsp; 304&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286<br>

    6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98&nbsp;&nbsp;&nbsp; 120&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284&nbsp;&nbsp;&nbsp; 312&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 282&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284<br>

    <br>

    <br>

    and needs to be:<br>

    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;

      charset=ISO-8859-1">

    &nbsp; BMC3&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; Cpi4&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; epic23989s<br>

    1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98 /106&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286/288&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284/284<br>

    2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 116/116&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284/308&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286/286<br>

    3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 108/116&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302/304&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286/288<br>

    4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 106/118&nbsp;&nbsp;&nbsp; 288/302&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 286/286<br>

    5&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98/98&nbsp;&nbsp;&nbsp; 294/304&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284/286<br>

    6&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98/120&nbsp;&nbsp;&nbsp; 284/312&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 282/284<br>

    <br>

    in order to import into genind object<br>

    <br>

    cheers<br>

    <br>

    Nevil Amos<br>

  </body>

</html>