<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.17093" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Verdana size=2><SPAN lang=EN>
<P>Dear Thibaut,</P>
<P>I am using your program DAPC to define the number of clusters in a dataset of 
400 individuals and 374 SNPs. With find.clusters I get a assignment per 
individual to each cluster. What I am looking for is the probability of 
assignment to each of the (for example) 3 groups, when k=3. The idea is to make 
a graph like figure 4 in the attached paper.</P>
<P>Is that possible? I think it should be because within the find.clusters the 
program must use some stats in the assignment of the clusters to each 
individual. When I use the $posterior command on the clusterfile it gives me 
NULL as answer. And the posterior command gives with predefined groups only 0 or 
1 for the probabilities of assignment, corresponding to what was predefined.</P>
<P>Thanks in advance,</P>
<P>Rudy Jonker</P></SPAN></FONT></DIV></BODY></HTML>