
<html>

<body>

Dear All,<br>

I would like to combine PCA and geographic information (as in sPCA) using

sequence data (I don't have genotype data available). Is this possible,

for example by transforming polymorphic sites into SNP genotypes (but

problem with linkage disequilibrium (?))? If so, how? If not, can anyone

suggest an alternative technique?<br>

Thank you!<br>

Have a nice day,<br>

Sofie<br>

<x-sigsep><p></x-sigsep>

Sofie Vandewoestijne<br>

Postdoctoral fellow<br>

Biodiversity Research Centre<br>

Catholic University Louvain<br>

Place Croix du Sud 5<br>

B-1348 Louvain-la-Neuve<br>

Belgium<br><br>

Tel: 32 (0)10 473454<br>

Fax: 32 (0)10 473490<br><br>

<font face="Webdings" size=5 color="#009999"><b>P</font>

<font color="#009999">

</font><font face="Verdana" size=1 color="#008080">Please consider your

environmental responsibility before printing this e-mail<br>

</font></b></body>

</html>